为研究上海选育群体(SC)、浙江养殖群体(ZJ)和泰国野生群体(TL)3个罗氏沼虾群体的遗传多样性,实验对3个不同群体的线粒体CO Ⅰ 基因序列进行PCR扩增和测定。在长度为458 bp的CO Ⅰ 基因序列中,只检测到8个变异位点和4个单倍型;平均A+T含量(54.4%)高于G+C含量(45.7%)。遗传变异参数分析显示,单倍型多样性指数最高为TL群体(Hd=0.733),核苷酸多样性指数最高为ZJ群体(π=0.005)。AMOVA分析表明,来自群体间的遗传变异(74.5%)高于来自群体内的遗传变异(25.5%)。采用NJ法和UPMGA法构建的系统进化树的趋势一致,都显示SC群体和ZJ群体遗传关系最近,首先聚在一起成为一小支,然后再与TL群体聚为另一支。研究结果可为罗氏沼虾种质资源保护和利用提供参考。
